江苏省转基因安全评价公共技术服务中心依托于江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所，于2010年由江苏省科学技术厅批准建设，2012年基本建设完成。中心现有固定人员17人，主要面向全省开展转基因作物环境安全评价和外源基因组分检测服务等工作。
    2015年5月在中心基本组成框架上成立了农业农村部农产加工品监督检验测试中心（南京）转基因产品安全检测室，可对外提供水稻、玉米、小麦、油菜、棉花、大豆等12种作物的转基因组分检测服务和转基因水稻、玉米、棉花等作物环境安全评价。
    中心目前在江苏省农业科学院南京本部建立了符合《农业转基因生物安全监督检验测试机构基本条件》的转基因组分检测室，配备数字PCR仪、荧光定量PCR仪、梯度PCR仪、蛋白双向电泳、酶标仪等检测仪器设备30余台（套）。同时按《农业部2406号公告-3-2016 农业转基因生物安全监管通用要求 试验基地》要求在江苏省农业科学院六合实验基地建设完成转基因作物环境安全评价试验基地。基地占地面积150亩，配备了全覆盖的安全监控系统、生物灭活装置等安全设施，同时建设完成标准隔离围墙、转基因专用挂藏室、仓库、晒场和秸秆焚烧炉等设施。
    中心自建成以来，每年对外提供转基因组分检测服务1000项（次）以上，同时承担江苏省农业科学院、南京农业大学、中国农科院作物科学研究所等单位转基因水稻、小麦、玉米、棉花等作物的环境安全评价工作，促进了相关单位转基因研究和产业化进程，取得了良好的社会效益。